将 bulk 队列中的预后信息整合到单个细胞级别，从而识别与不良结局相关的 High-Risk 细胞群 ,模型除了给bulk样本风险得分以外，还能够给每个单细胞风险得分。所以在此基础上，能够筛选预后相关的高风险细胞亚群
分析药物敏感性的R包--oncoPredict 在做肿瘤分型的时，对不同分型的样本进行药物敏感性的分析，以便找出对特定分型敏感的药物
分解 scRNA-seq 数据，使用NMF 有效减少大型复杂基质 ,转化为一些可解释的基因程序
单细胞联合bulk数据分析 2024 Q1 9.4
2023 Nature Communications，Single-cell analysis reveals prognostic fibroblast subpopulations linked to molecular and immunological subtypes of lung cancer
关于肺癌肿瘤中成纤维细胞（CAFs）单细胞研究
张泽民 cancer cell 2025集成的单细胞和空间转录组学揭示了参与胰腺癌神经侵袭的不同细胞亚型
2025 16.6 Q1 Cancer Res 从样本间异质性的角度去选目的细胞，泛癌分析细化肿瘤浸润树突状细胞的单细胞图谱
Monopogen 是一款专门用于单细胞测序数据的单核苷酸变异（SNV）调用分析工具。Monopogen 支持多种单细胞测序技术生成的数据，如 10x 5'、10x 3'、单细胞 ATAC-seq 和 scDNA-seq 等。Monopogen 通过三个模块提供全面的 SNV 调用功能：数据预处理、杂合子 SNV 调用和体细胞 SNV 调用
整合空间转录组分子谱，组织学图像，和空间信息进行多样本空间域聚类
单细胞irGSEA分析:整合多种富集分析方式的R包
Pharmacol Res(IF=9.78) | TCMChat中医药大模型：精准解析中药特性与方剂组成，实现诊断和中药方剂推荐
扰动-响应评分 （PS） 分析是一种量化不同扰动响应并在单细胞扰动数据集中发现新的生物学见解的方法
AgentVerse 旨在促进在各种应用程序中部署多个基于 LLM 的代理。AgentVerse 主要提供两个框架：任务解决和模拟
